Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk8Q8R3L8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk8Q8R3L8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk8Q8R3L8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk8Q8R3L8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms