Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U2

Nepro, Nucleolus and neural progenitor protein, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeproQ8R2U2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeproQ8R2U2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeproQ8R2U2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeproQ8R2U2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeproQ8R2U2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeproQ8R2U2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeproQ8R2U2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NeproQ8R2U2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NeproQ8R2U2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms