Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC16Q8NEE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC16Q8NEE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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