Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC197Q8NCU1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC197Q8NCU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC197Q8NCU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms