Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A9Q8NBW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A9Q8NBW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms