Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD1Q8NBU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATAD1Q8NBU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD1Q8NBU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms