Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZIC4Q8N9L1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZIC4Q8N9L1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZIC4Q8N9L1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms