Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC82Q8N4S0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC82Q8N4S0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC82Q8N4S0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms