Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Hecw1Q8K4P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hecw1Q8K4P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Hecw1Q8K4P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Hecw1Q8K4P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 506.8 ms