Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk5rap2Q8K389 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk5rap2Q8K389 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdk5rap2Q8K389 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdk5rap2Q8K389 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms