Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shtn1Q8K2Q9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shtn1Q8K2Q9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shtn1Q8K2Q9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms