Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d5Q8JZW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sh2d5Q8JZW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d5Q8JZW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d5Q8JZW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d5Q8JZW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms