Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne5Q8JZW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne5Q8JZW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne5Q8JZW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne5Q8JZW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms