Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP3Q8IZU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms