Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PARP9Q8IXQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP9Q8IXQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARP9Q8IXQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.1 ms