Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PASD1Q8IV76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms