Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR49Q8IV35 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR49Q8IV35 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR49Q8IV35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR49Q8IV35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms