Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Syne4Q8CII8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syne4Q8CII8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syne4Q8CII8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syne4Q8CII8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms