Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NgefQ8CHT1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NgefQ8CHT1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NgefQ8CHT1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NgefQ8CHT1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms