Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbm28Q8CGC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm28Q8CGC6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm28Q8CGC6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm28Q8CGC6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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