Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam228aQ8CDW1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam228aQ8CDW1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam228aQ8CDW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms