Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lrrc9Q8CDN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lrrc9Q8CDN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lrrc9Q8CDN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lrrc9Q8CDN9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms