Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Phf20l1Q8CCJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms