Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim35Q8C006 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim35Q8C006 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms