Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc12Q8BW49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc12Q8BW49 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc12Q8BW49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc12Q8BW49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.4 ms