Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Catsper4Q8BVN3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Catsper4Q8BVN3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms