Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod1Q8BVA4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms