Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik4Q8BMF5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Grik4Q8BMF5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik4Q8BMF5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms