Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd55Q8BLD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd55Q8BLD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ankrd55Q8BLD6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms