Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC84Q86UT8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC84Q86UT8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC84Q86UT8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms