Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prima1Q810F0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prima1Q810F0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prima1Q810F0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.8 ms