Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI1

Trnp1, TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1Q80ZI1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trnp1Q80ZI1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trnp1Q80ZI1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trnp1Q80ZI1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trnp1Q80ZI1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trnp1Q80ZI1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trnp1Q80ZI1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trnp1Q80ZI1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trnp1Q80ZI1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms