Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc27Q80YS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc27Q80YS5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc27Q80YS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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