Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm5bQ80Y84 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm5bQ80Y84 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Kdm5bQ80Y84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5bQ80Y84 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms