Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RbsnQ80Y56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RbsnQ80Y56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RbsnQ80Y56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbsnQ80Y56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RbsnQ80Y56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms