Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nrde2Q80XC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nrde2Q80XC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrde2Q80XC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms