Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnma8aQ80VM8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pnma8aQ80VM8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pnma8aQ80VM8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms