Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc155Q80VJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc155Q80VJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc155Q80VJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms