Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttll4Q80UG8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttll4Q80UG8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1255.7 ms