Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp8Q80U87 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp8Q80U87 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp8Q80U87 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp8Q80U87 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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