Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTU1Q7Z7A3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTU1Q7Z7A3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTU1Q7Z7A3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTU1Q7Z7A3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms