Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SZRD1Q7Z422 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SZRD1Q7Z422 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SZRD1Q7Z422 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms