Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mcph1Q7TT79 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mcph1Q7TT79 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mcph1Q7TT79 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mcph1Q7TT79 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms