Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim17Q7TPM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim17Q7TPM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim17Q7TPM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms