Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbno2Q7TNB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sbno2Q7TNB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sbno2Q7TNB8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sbno2Q7TNB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms