Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmc8Q7TN58 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmc8Q7TN58 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmc8Q7TN58 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms