Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZD4Q76G19 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD4Q76G19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD4Q76G19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD4Q76G19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms