Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nme8Q715T0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nme8Q715T0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nme8Q715T0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nme8Q715T0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms