Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SynmQ70IV5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SynmQ70IV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SynmQ70IV5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
SynmQ70IV5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SynmQ70IV5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SynmQ70IV5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SynmQ70IV5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SynmQ70IV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SynmQ70IV5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms