Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP49Q70CQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP49Q70CQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP49Q70CQ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP49Q70CQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms